More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  100 
 
 		 290 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  70.17 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  71.37 
 
 		 294 aa  338  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  68.42 
 
 		 278 aa  335  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  62.14 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  56.63 
 
 		 279 aa  292  6e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  56.9 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  53.93 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  54.4 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  56.11 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  48.18 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  48.5 
 
 		 274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  55.66 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  55.66 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  55.66 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  57.21 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  46.24 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  53.68 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  49.17 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  46.42 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  47.16 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  47.54 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  48.07 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  48.87 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  46.13 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  43.55 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  40.89 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  40.86 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  46.76 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  46.29 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  44.4 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  43.61 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  44.59 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  43.5 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  42 
 
 		 355 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  37.84 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.94 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.18 
 
 		 600 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  36.41 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.41 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  34.08 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.14 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.08 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.32 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  38.97 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.2 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  33.64 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.2 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.2 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.32 
 
 		 751 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  34.11 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  34.29 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.08 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  35.53 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  30.14 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2306  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  34.52 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.95 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  27.88 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  27.88 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.47 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 254 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.2 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 		 503 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.12 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>