More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2522 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  90.51 
 
 
294 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  60.89 
 
 
290 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  57.68 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  57.93 
 
 
296 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  57.09 
 
 
294 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  57.46 
 
 
323 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  52.7 
 
 
296 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  56 
 
 
294 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  52.42 
 
 
305 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  49.58 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 
275 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 
275 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 
275 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  44.4 
 
 
283 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  41.83 
 
 
289 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  47.83 
 
 
285 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  44.77 
 
 
269 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  46.61 
 
 
295 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  45.95 
 
 
304 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.54 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  38.28 
 
 
275 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  47.46 
 
 
321 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  45.95 
 
 
297 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  44.59 
 
 
290 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  42.62 
 
 
290 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
277 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  44.8 
 
 
294 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  43.67 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.52 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  35.54 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  41.85 
 
 
278 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  42.79 
 
 
282 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  36.68 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  38.63 
 
 
281 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  35.63 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  37.34 
 
 
323 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
305 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 
281 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  37.28 
 
 
286 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  34.56 
 
 
323 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 
355 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 
318 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.65 
 
 
276 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 
302 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 
271 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.86 
 
 
276 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 
271 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
276 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  32.64 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.26 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.26 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 
273 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
276 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.93 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  34.08 
 
 
323 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
324 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  33.79 
 
 
324 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  32.11 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  33.61 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  36.55 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 
297 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
250 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  30.58 
 
 
340 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.23 
 
 
271 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
310 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  31.36 
 
 
278 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 
301 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  27.5 
 
 
328 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.91 
 
 
324 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 
341 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 
295 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 
295 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
284 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.17 
 
 
284 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 
246 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
331 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  30.89 
 
 
278 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.31 
 
 
277 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>