More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1779 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  57.69 
 
 
271 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  59.27 
 
 
271 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  56.32 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  59.68 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  56.23 
 
 
271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  57.47 
 
 
278 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  59.27 
 
 
284 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  59.27 
 
 
284 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  57.31 
 
 
292 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  55.94 
 
 
278 aa  284  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  56.54 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  57.32 
 
 
271 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  58.63 
 
 
279 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  56.7 
 
 
278 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.02 
 
 
272 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.92 
 
 
272 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  52.29 
 
 
268 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  56.1 
 
 
271 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  53.23 
 
 
267 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  52.99 
 
 
268 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  52.02 
 
 
295 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  52.02 
 
 
295 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  39.55 
 
 
271 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  39.18 
 
 
273 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
282 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  38.95 
 
 
267 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  38 
 
 
274 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  39.22 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9241  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  37.36 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  40.24 
 
 
275 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  37.3 
 
 
278 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
270 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.69 
 
 
279 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  32.95 
 
 
280 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
276 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2912  glutamine ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34 
 
 
277 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  36.33 
 
 
286 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.33 
 
 
276 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.33 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.81 
 
 
277 aa  142  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.75 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.75 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  34.75 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.75 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.4 
 
 
276 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  34.4 
 
 
276 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.1 
 
 
276 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  32.18 
 
 
280 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.91 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
275 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  35.16 
 
 
260 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.61 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  31.93 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  36.22 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  33.18 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.72 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  36.71 
 
 
267 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
266 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
275 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  31.69 
 
 
290 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  37.1 
 
 
290 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  34.96 
 
 
265 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  29.78 
 
 
275 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
296 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  34.6 
 
 
297 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
255 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
285 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 
296 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
290 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.86 
 
 
300 aa  122  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  33.9 
 
 
264 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 
273 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  33.9 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  33.9 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>