More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  100 
 
 		 324 aa  641    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  35.2 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  40 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  34.05 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  39.22 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  40.28 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.21 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  37.61 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.49 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  40.29 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  37.56 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.07 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  38.97 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  32.51 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  31.78 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  36.53 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.63 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  35 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  38.19 
 
 		 283 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  30.43 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  30.74 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.04 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.61 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  29.61 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  33.79 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.61 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  29.18 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  35.17 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  35.17 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  34.75 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.89 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  29.49 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.37 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.19 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  27.61 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  30.99 
 
 		 269 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  29.82 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  31.11 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  31.45 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  32.19 
 
 		 281 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.76 
 
 		 278 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  33.01 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.68 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 270 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  25.09 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  33.03 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.03 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  33.03 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.03 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.57 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  32.57 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.71 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>