More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4395 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 340 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  52.17 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  53.92 
 
 		 326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  49.12 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  49.12 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  53.97 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  53.36 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  49.34 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  45.91 
 
 		 324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  38.98 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 341 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  39.85 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  43.85 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 276 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.3 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 296 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  35.39 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.81 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  37.77 
 
 		 304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  34.05 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  38.6 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  35.27 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  32.2 
 
 		 355 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  37.73 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.05 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.26 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 		 385 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  37.33 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 276 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.28 
 
 		 271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  38.46 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  34.55 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  34.8 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.84 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  33.18 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 277 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.09 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  32.47 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 279 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.8 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  35.11 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.45 
 
 		 751 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  34.72 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  30.58 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  27.7 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.05 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.5 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.5 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  29.06 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.01 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>