More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3163 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  39.08 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  36.88 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  39.56 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  38.41 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  38.46 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  37.89 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.9 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  37.55 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  37.55 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  37.55 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  37.86 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  37.86 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  37.98 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  37.98 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  33.81 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  37.45 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  37.55 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  37.45 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.93 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  37.45 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  36.15 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  32.37 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  37.37 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  37.04 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  36.22 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  33.93 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  33.93 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  33.93 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  35.53 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  36.26 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  36.3 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  34.08 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.08 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.08 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  33.45 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  33.58 
 
 		 302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  35.76 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.08 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.34 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  33.57 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  34.94 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.22 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  32.85 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.55 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  34.8 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  35.57 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  35.21 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.13 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  33.45 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  33.69 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  34.93 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  34.93 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4583  glutamate/aspartate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  32.79 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.8955  decreased coverage  0.00199709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  33.22 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>