More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1937 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  76.47 
 
 
295 aa  434  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  71.19 
 
 
296 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  69.18 
 
 
294 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  69 
 
 
293 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  58.99 
 
 
289 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  56.31 
 
 
297 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  56.36 
 
 
297 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  52.92 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  52.41 
 
 
326 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  48.63 
 
 
330 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 
306 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  47.64 
 
 
299 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  49.31 
 
 
302 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  53.62 
 
 
297 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  50.17 
 
 
299 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  46.8 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  47.46 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  50.72 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  50.36 
 
 
330 aa  285  9e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  51.03 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  51.03 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  51.37 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  51.45 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.17 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.17 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  51.03 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  49.49 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  50.34 
 
 
297 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  48.81 
 
 
298 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
334 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  48.98 
 
 
302 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  51.09 
 
 
297 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.68 
 
 
297 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  52.71 
 
 
304 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  50.34 
 
 
297 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  50.34 
 
 
297 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  51.87 
 
 
359 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.76 
 
 
306 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  51.87 
 
 
299 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  51.87 
 
 
299 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  51.87 
 
 
299 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  51.87 
 
 
299 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  51.87 
 
 
298 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  51.87 
 
 
298 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  48.98 
 
 
302 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
297 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  50.54 
 
 
308 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 
306 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  49.64 
 
 
298 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 
306 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  48.46 
 
 
300 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  48.1 
 
 
313 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  47.16 
 
 
302 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.46 
 
 
308 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  50.37 
 
 
302 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 
306 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
299 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  48.08 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  49.64 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  50.37 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  50.37 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  50 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  53.12 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  46.82 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  46.82 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  46.82 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  46.98 
 
 
301 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  47.74 
 
 
298 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  49.46 
 
 
302 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  50 
 
 
302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  50 
 
 
302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  47.59 
 
 
333 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  46.49 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  49.09 
 
 
302 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  49.63 
 
 
302 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  47.64 
 
 
299 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  47.39 
 
 
298 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  49.1 
 
 
302 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  50.18 
 
 
307 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.75 
 
 
299 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.55 
 
 
306 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  51.49 
 
 
302 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  50.55 
 
 
305 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  50.55 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  48.25 
 
 
302 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  49.82 
 
 
307 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  49.63 
 
 
302 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  46.07 
 
 
312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  50.18 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  46.44 
 
 
298 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 
298 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 
298 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 
298 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 
298 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  47.14 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  46.08 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  48.61 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>