More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4441 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
299 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  99.33 
 
 
299 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  68.23 
 
 
298 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 
303 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  40.75 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  40.77 
 
 
300 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  42.14 
 
 
302 aa  232  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 
302 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  38.77 
 
 
303 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  38.91 
 
 
276 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
306 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  36.56 
 
 
302 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 
272 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 
272 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
295 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  35.42 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  33.96 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  36.47 
 
 
326 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  35.23 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  35.23 
 
 
302 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
294 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 
273 aa  146  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 
334 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 
330 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 
271 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 
295 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
299 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
306 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.21 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  33.87 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  33.33 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  33.33 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  33.33 
 
 
297 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  32.85 
 
 
297 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  31.89 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 
297 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  32.97 
 
 
298 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 
312 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  32.1 
 
 
302 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 
307 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
313 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  34.22 
 
 
302 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 
307 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  32.33 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  30.96 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  30.96 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  30.56 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  32.33 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  30.96 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  30.96 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.41 
 
 
313 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  30.19 
 
 
299 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  30.19 
 
 
299 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  30.45 
 
 
298 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.19 
 
 
298 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  30.19 
 
 
299 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.19 
 
 
359 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.19 
 
 
299 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  30.19 
 
 
298 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0587  extracellular solute-binding protein family 3  33.97 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  32.63 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  31.95 
 
 
302 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  31.95 
 
 
302 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  32.71 
 
 
308 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.63 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  32.87 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  31.95 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.21 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  31.95 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  31.97 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.21 
 
 
308 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
304 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0608  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 
296 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400599  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  31.14 
 
 
298 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
298 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  31.58 
 
 
302 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  34.47 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  34.47 
 
 
302 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.41 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  31.46 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>