More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0070 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
293 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  69.34 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  68.15 
 
 
295 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  70.59 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  62.41 
 
 
294 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  57.61 
 
 
289 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  52.8 
 
 
297 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  53.06 
 
 
297 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  51.08 
 
 
296 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  49.49 
 
 
302 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  49.15 
 
 
302 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  47.77 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50.87 
 
 
326 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  49.13 
 
 
297 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  48.46 
 
 
299 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  49.45 
 
 
319 aa  278  9e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  49.08 
 
 
330 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  49.13 
 
 
298 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  50.56 
 
 
297 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 
297 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  49.64 
 
 
297 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  48.44 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  48.44 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  47.57 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.44 
 
 
297 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  49.07 
 
 
302 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
297 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
297 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 
298 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.9 
 
 
298 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 
298 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50 
 
 
359 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50 
 
 
298 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.9 
 
 
328 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  47.9 
 
 
297 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  50 
 
 
299 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50 
 
 
299 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  50 
 
 
299 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.9 
 
 
328 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  50 
 
 
298 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  50 
 
 
299 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  49.26 
 
 
303 aa  268  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  47.97 
 
 
298 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  47.97 
 
 
298 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  48.15 
 
 
298 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  47.97 
 
 
298 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  47.57 
 
 
301 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  47.92 
 
 
330 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 
302 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  48.88 
 
 
302 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  47.69 
 
 
301 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  50.56 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  45.17 
 
 
299 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  47.57 
 
 
306 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  49.28 
 
 
302 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  48.51 
 
 
302 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.4 
 
 
308 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  47.01 
 
 
334 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  48.51 
 
 
302 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  47.76 
 
 
305 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  46.1 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  48.51 
 
 
302 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  48.51 
 
 
302 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 
333 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 
298 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  46.49 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 
302 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2255  extracellular solute-binding protein  48.67 
 
 
307 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947738  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  49.25 
 
 
299 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  46.18 
 
 
302 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  46.18 
 
 
302 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  48.51 
 
 
302 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  46.18 
 
 
302 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  48.13 
 
 
302 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  47.45 
 
 
302 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  46.27 
 
 
310 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  48.13 
 
 
302 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  45.97 
 
 
302 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  47.93 
 
 
313 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  51.32 
 
 
307 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  47.01 
 
 
311 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  51.32 
 
 
307 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  45.8 
 
 
299 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  43.79 
 
 
299 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  48.15 
 
 
298 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  46 
 
 
301 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  52.98 
 
 
297 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  49.25 
 
 
298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  48.52 
 
 
303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  49.45 
 
 
304 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  46.64 
 
 
299 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  47.1 
 
 
297 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  48.15 
 
 
303 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.53 
 
 
306 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  45.68 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  47.96 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  44.73 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  47.59 
 
 
300 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>