More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2874 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  68.23 
 
 		 299 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  68.23 
 
 		 299 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  46.13 
 
 		 303 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  40.89 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  39.39 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  38.69 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  40.78 
 
 		 276 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  38.21 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  36.79 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  36.79 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  31.38 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  31.67 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  31.89 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0587  extracellular solute-binding protein family 3  32.58 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  31.2 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  32.66 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  31.32 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  31.32 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  30.94 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  30.74 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  30.74 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  30.74 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  30.74 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  30.74 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  30.94 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0608  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  30.94 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  29.41 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  30.94 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  30.57 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  35.1 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.51 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.93 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.93 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  29.93 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  29.82 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.93 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  31.11 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  27.86 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6965  extracellular solute-binding protein family 3  30.42 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2247  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5423  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  30.5 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  29.12 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.12 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.12 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  29.12 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.12 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.12 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  29.12 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  30.5 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.08 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  29.76 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.28 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>