More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3636 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  70.82 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  50.71 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  45.74 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  45.74 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  45.05 
 
 		 295 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  41 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  36.67 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  36.67 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  37.29 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  34.56 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  34.6 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  29.35 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  32.64 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  32.68 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  32.68 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  32.68 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.38 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  30.62 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  28.52 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.52 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  31.75 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  28.52 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  28.52 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.52 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  31.75 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  31.75 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  31.75 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.52 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.52 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  30.04 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.87 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  26.87 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.87 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  29.9 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  28.15 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  27.38 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  28.31 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.53 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  28.02 
 
 		 301 aa  85.9  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  28.15 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  28.15 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  27.78 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  27.78 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  29.46 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.45 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  29.18 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  26.64 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  29.55 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.57 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  30.28 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>