More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2671 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  99.65 
 
 
285 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  58.51 
 
 
243 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  37.31 
 
 
276 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
272 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
272 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  32.8 
 
 
298 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 
299 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4514  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
286 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0322747  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  31.14 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
303 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  30.69 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  29.26 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  27.45 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
296 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  26.75 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  27.57 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  27.76 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  27.76 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  27.76 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  27.76 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  27.76 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.44 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  26.05 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  27.35 
 
 
302 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  27.35 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  27.35 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  27.16 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  26.94 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  26.94 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  25.1 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  25.51 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  25.1 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  25.1 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.57 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  26.12 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4074  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  26.29 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  24.81 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.29 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.29 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.69 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.59 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.82 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.91 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  26.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  26.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  26.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.91 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.91 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  23.69 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.91 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  24.28 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  24.22 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.51 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  22.96 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.14 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  25.29 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  25.29 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.19 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.453219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>