More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4222 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  40 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  40 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  39.77 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  37.62 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5423  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  39.84 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  41.39 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  37.46 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  37.59 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_003296  RS05478  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.86 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  43.44 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2540  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3638  extracellular solute-binding protein family 3  37.32 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  35.45 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  36.59 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  38.6 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4329  extracellular solute-binding protein family 3  35.97 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.1 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5026  extracellular solute-binding protein family 3  35.79 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0973  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.03 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00938185  normal  0.751269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4420  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0826  extracellular solute-binding protein family 3  37.98 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2087  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  38.18 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1123  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00011354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3315  extracellular solute-binding protein family 3  36.75 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.97 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2361  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4535  extracellular solute-binding protein  37.94 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223425  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  37.32 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  40.74 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  37.22 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  36.67 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  38.8 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  34.94 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  38.8 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  39.11 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  38.8 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  38.8 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.01 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  38.31 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  38.31 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  38.52 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.69 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  38.52 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  34.69 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  34.01 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  38.84 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  38.52 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  38.52 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  37.25 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0897  extracellular solute-binding protein family 3  38.11 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.529927  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  38.52 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.89 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  36.3 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  36.3 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  34.91 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  36.67 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  34.91 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  34.91 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6783  extracellular solute-binding protein family 3  36.43 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  38.11 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  38.11 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>