More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2503 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  98.59 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  87.28 
 
 		 282 aa  517  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  70.41 
 
 		 279 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  71.48 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  72.31 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  67.63 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  33.64 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  33.07 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  33.49 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  28.94 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.38 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.92 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.92 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  30.84 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  27.13 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  28.1 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0779  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 350 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  28.1 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  27.68 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  28.1 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 268 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.99 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.99 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.92 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.64 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.98 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.1 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.98 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  25.84 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.63 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 341 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.61 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.61 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.61 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.61 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  29.86 
 
 		 288 aa  90.1  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.81 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3754  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.248765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  25.09 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.14 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.33 
 
 		 247 aa  89  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 272 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  25.09 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  32.42 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.41 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  26.15 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0925  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.796106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  31.18 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 267 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.33 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  27.82 
 
 		 345 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.67 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>