More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1465 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
302 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  99.67 
 
 
302 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  50.17 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  49.64 
 
 
302 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  48.93 
 
 
303 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  45.74 
 
 
306 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 
303 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  42.09 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  42.09 
 
 
299 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  41.75 
 
 
298 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  41.03 
 
 
300 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  33.46 
 
 
285 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  35.77 
 
 
276 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
286 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  32.39 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  32.39 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 
271 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
273 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  30.22 
 
 
299 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  29.18 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  29.18 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  29.18 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  29.18 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  29.14 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  28.79 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  29.69 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  30 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  28.69 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  28.69 
 
 
305 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  28.69 
 
 
305 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 
297 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  28.69 
 
 
305 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  29.57 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
296 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  27.47 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  29.57 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  27.99 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 
307 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  28.63 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 
307 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.91 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5289  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.07 
 
 
297 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.37 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1655  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  27.78 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.92194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.24 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  29.96 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.55 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  28.52 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.2 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.88 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2829  extracellular solute-binding protein family 3  29.45 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.0146067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  27.64 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  26.11 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4222  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.453219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.11 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.04 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>