53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2073 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  56.18 
 
 		 285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  41.26 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  34.3 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 		 302 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  33.78 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  33.01 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  23.66 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  23.66 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.61 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 934 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.17 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.43 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0734  hypothetical protein  24.64 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  26.43 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  26.43 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5989  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2743  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0284405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.01 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  25.6 
 
 		 928 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0578  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.92 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1729  CjaC  29.1 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.71 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004010  GGDEF domain protein  29.89 
 
 		 667 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3985  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.394348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  23.19 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  25.6 
 
 		 928 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  25.6 
 
 		 928 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3502  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1490 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1030  histidine kinase  24.23 
 
 		 781 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372079  normal  0.0935457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.99 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  25.15 
 
 		 1212 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  22.41 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3023  extracellular solute-binding protein family 3  21.84 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  24.23 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  24.06 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>