231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04251 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04251  ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0599  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 
285 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2073  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
286 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3636  extracellular solute-binding protein family 3  34.53 
 
 
306 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1465  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 
302 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1492  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 
302 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.315517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3640  extracellular solute-binding protein family 3  34.06 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.906324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2138  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 
295 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  28.42 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  28.42 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3766  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
300 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  26 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3405  extracellular solute-binding protein family 3  25.88 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3456  extracellular solute-binding protein family 3  23.25 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4514  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0322747  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2648  extracellular solute-binding protein family 3  23.25 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3008  extracellular solute-binding protein family 3  23.79 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.83 
 
 
272 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3433  extracellular solute-binding protein family 3  23.08 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2671  extracellular solute-binding protein family 3  23.08 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  23.79 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.84 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.92 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  24.35 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  27.44 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  27.44 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.44 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  24.61 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  21.17 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  23.46 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  23.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  28.49 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  23.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  23.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.28 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.53 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  27.96 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  20.59 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  30.05 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  23.26 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  23.26 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  23.26 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  23.26 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  23.35 
 
 
266 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.83 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  23.85 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.13 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  22.87 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.84 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  29.71 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  23.85 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.64 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  22.87 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.64 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.37 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.59 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.59 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  35 
 
 
596 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.12 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.88 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.62 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
243 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
243 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
243 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.39 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.29 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  20.71 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>