More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4964 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  96.35 
 
 		 274 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  90.34 
 
 		 269 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  77.37 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.35 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  58.33 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  55.1 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  53.96 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  54.48 
 
 		 261 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  57.94 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  53.41 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  52.38 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  54.65 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  48.68 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.68 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  51.05 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  48.43 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  47.64 
 
 		 268 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  50.42 
 
 		 274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 261 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  45.8 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  46.48 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  48.54 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  48.12 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  48.54 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  45.63 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.08 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  46.67 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  46.15 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  42.21 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  45.24 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 		 265 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  44.16 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  39.83 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  39.54 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  34.26 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.91 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.75 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.75 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.62 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  34.95 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.76 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.85 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.89 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  27.51 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  37.18 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.01 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  27.14 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4132  putative ABC transporter binding protein subunit  28.35 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  36.52 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 341 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  26.39 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  30.24 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.96 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47920  putative binding protein component of ABC transporter  27.95 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0688655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>