More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4514 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  58.3 
 
 
263 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  58.12 
 
 
269 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  50.57 
 
 
266 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  55.56 
 
 
261 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  55.98 
 
 
266 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  55.94 
 
 
261 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  55.56 
 
 
263 aa  276  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  53.33 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  54.58 
 
 
267 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.94 
 
 
261 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  53.78 
 
 
267 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  56.58 
 
 
247 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  56.58 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  56.58 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  52.94 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  54.66 
 
 
261 aa  258  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  53.33 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  55.26 
 
 
261 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  50.82 
 
 
264 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  52.71 
 
 
261 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  50.4 
 
 
268 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 
274 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  49.6 
 
 
268 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  51.49 
 
 
275 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  51.91 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  48.5 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  51.49 
 
 
267 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.79 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  48.37 
 
 
263 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  51.05 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  48.02 
 
 
263 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  51.72 
 
 
240 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  49.38 
 
 
262 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.64 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  48.75 
 
 
269 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.21 
 
 
274 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  44.83 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  42.06 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  42.5 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  41.11 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  42.68 
 
 
275 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
267 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
268 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  38.33 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
265 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
265 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
275 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 
265 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 
255 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
263 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
268 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
266 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.57 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  33.74 
 
 
274 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
271 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
292 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.6 
 
 
271 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 
276 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  30.33 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
266 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  31.47 
 
 
268 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  31.87 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.68 
 
 
272 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.63 
 
 
279 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 
278 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  29.08 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.79 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
278 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  31.39 
 
 
278 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
275 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  30.88 
 
 
278 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  31.53 
 
 
244 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.14 
 
 
278 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.14 
 
 
278 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
277 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>