More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6374 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  94.6 
 
 
278 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  86.02 
 
 
279 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  69.6 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  68.06 
 
 
280 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2912  glutamine ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.69 
 
 
277 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 
278 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  41.89 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9241  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.33 
 
 
272 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  33.94 
 
 
284 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
274 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
276 aa  155  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
282 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 
281 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 
281 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  32.01 
 
 
278 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.23 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  32.37 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.09 
 
 
284 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 
278 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
267 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.72 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.53 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.85 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
271 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
271 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
271 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.62 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.62 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  34.85 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
289 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  28.73 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.73 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.56 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.83 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.61 
 
 
267 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 
246 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
275 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  31.33 
 
 
290 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 
261 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 
278 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 
261 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
261 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
260 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4132  putative ABC transporter binding protein subunit  28.74 
 
 
273 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
265 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.42 
 
 
261 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  25.56 
 
 
275 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  27.06 
 
 
281 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47920  putative binding protein component of ABC transporter  27.94 
 
 
273 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0688655  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
250 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
274 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 
261 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
268 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
266 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.27 
 
 
267 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 
286 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
294 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 
269 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 
268 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
281 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
341 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 
272 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.6 
 
 
271 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 
265 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
264 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  28.22 
 
 
273 aa  99  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.15 
 
 
274 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.49 
 
 
276 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.27 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>