More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1686 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  96.35 
 
 
274 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  91.18 
 
 
269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  77.74 
 
 
274 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.75 
 
 
267 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  58.33 
 
 
267 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  55.51 
 
 
269 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  54.85 
 
 
261 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  54.85 
 
 
261 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  57.94 
 
 
266 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  53.41 
 
 
260 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  55.43 
 
 
268 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  56.41 
 
 
247 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  56.41 
 
 
268 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  51.98 
 
 
265 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 
261 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.06 
 
 
261 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  49.21 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  51.46 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  48.43 
 
 
268 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 
240 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  48.41 
 
 
254 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 
261 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  46.56 
 
 
263 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  46.48 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  48.12 
 
 
275 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  46.64 
 
 
268 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  47.7 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  48.12 
 
 
275 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  47.5 
 
 
262 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.5 
 
 
262 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  45.24 
 
 
263 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  46.67 
 
 
262 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  46.15 
 
 
266 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  46.34 
 
 
263 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 
266 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  45.63 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 
260 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  45.18 
 
 
264 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 
265 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  44.16 
 
 
266 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  40.61 
 
 
265 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 
275 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  39.83 
 
 
268 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
260 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
275 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
267 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
266 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
263 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 
265 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
269 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 
274 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  34.26 
 
 
278 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
266 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
271 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
276 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 
278 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 
279 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.91 
 
 
279 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  32.94 
 
 
278 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.02 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.32 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.32 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.16 
 
 
272 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  36.2 
 
 
275 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 
295 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 
295 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
258 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.89 
 
 
265 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 
278 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
264 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 
264 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
276 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  37.18 
 
 
298 aa  99  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  27.14 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  37.08 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  26.77 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.73 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.57 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.17 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3314  extracellular solute-binding protein family 3  28.92 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.75 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4132  putative ABC transporter binding protein subunit  28.35 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>