More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0177 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  55.22 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  48.09 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  47.44 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  45.15 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  44.73 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  43.46 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.31 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.95 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  38.7 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  38.7 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  38.37 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 266 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  41.2 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.75 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  40.97 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  36.6 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  39.58 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  39.58 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.58 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 266 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  36.23 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  40.42 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  39.55 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  36.13 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  35.98 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.87 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.46 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.46 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  36.82 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.63 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  35.02 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  35.86 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.32 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  34.73 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  34.19 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  34.32 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  34.32 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.78 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.36 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.62 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.36 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.8 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.76 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.2 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.59 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  28.47 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>