More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0211 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
274 aa  550  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  84.39 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  88.7 
 
 
267 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  81.25 
 
 
275 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  80.51 
 
 
275 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  55.47 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  55.11 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  59.09 
 
 
269 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  56.64 
 
 
261 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  57.25 
 
 
268 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  57.25 
 
 
268 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  56.25 
 
 
261 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  57.37 
 
 
254 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  58.65 
 
 
240 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  54.51 
 
 
260 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  54.98 
 
 
268 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  55.47 
 
 
263 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  54.61 
 
 
268 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  57.69 
 
 
247 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  57.08 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  59.48 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  57.76 
 
 
266 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  54.8 
 
 
262 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.8 
 
 
262 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  57.68 
 
 
261 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  55.42 
 
 
263 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  54 
 
 
262 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  54.05 
 
 
261 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  53.97 
 
 
261 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.57 
 
 
261 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  57.01 
 
 
263 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  51.39 
 
 
266 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  48.2 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  52.3 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  51.9 
 
 
260 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.84 
 
 
274 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.22 
 
 
274 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  51.33 
 
 
266 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 
265 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 
265 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  47.37 
 
 
264 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  43.23 
 
 
266 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  43.08 
 
 
265 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 
268 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
265 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 
260 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
275 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  36.44 
 
 
268 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  37.01 
 
 
275 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 
273 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  36.82 
 
 
269 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 
267 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
266 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  36.63 
 
 
274 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 
265 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
255 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
263 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
276 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
266 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
271 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.61 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
271 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.73 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
271 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 
271 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
279 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4132  putative ABC transporter binding protein subunit  30.52 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 
271 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.45 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
261 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.08 
 
 
268 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 
278 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47920  putative binding protein component of ABC transporter  30.2 
 
 
273 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0688655  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  31.1 
 
 
278 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
267 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
271 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.95 
 
 
279 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.06 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.7 
 
 
284 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  29.44 
 
 
275 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>