More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1598 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  73.93 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  45.98 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  48.56 
 
 		 266 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  48.89 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 		 265 aa  215  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  40.42 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  41.84 
 
 		 275 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  38.33 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  40.94 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  36.9 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  39.17 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  37.12 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  39.17 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  39.17 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.02 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  36.64 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  35.95 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.86 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  37.74 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  36.02 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.71 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.91 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  37.25 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  37.29 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  38.07 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.96 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.33 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  32.5 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.93 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  31.17 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  34.6 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.89 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.56 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  35.42 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.1 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.78 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.78 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.78 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  29.69 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  35.06 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.27 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.8 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.66 
 
 		 266 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  28.91 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.66 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.27 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.83 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.27 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.34 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>