More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1056 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  68.2 
 
 
247 aa  325  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  58.37 
 
 
246 aa  267  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  58.37 
 
 
246 aa  266  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  42.01 
 
 
263 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  41.13 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  43.02 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  42.29 
 
 
257 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.61 
 
 
264 aa  175  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
242 aa  174  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  38.76 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  38.62 
 
 
268 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.53 
 
 
513 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  44.39 
 
 
244 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  34.4 
 
 
247 aa  168  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 
245 aa  168  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  38.37 
 
 
271 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
260 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
244 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  40.71 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  36.18 
 
 
247 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 
244 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  42.99 
 
 
285 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 
264 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.52 
 
 
244 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  43.38 
 
 
250 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 
268 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
286 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  37.2 
 
 
246 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  35.25 
 
 
258 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
222 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
261 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  36.86 
 
 
264 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  38.67 
 
 
271 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  37.65 
 
 
264 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  34.4 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 
282 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 
295 aa  152  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
284 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  36.64 
 
 
275 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  39.11 
 
 
272 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.66 
 
 
278 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  35.6 
 
 
238 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  36.21 
 
 
246 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  36.21 
 
 
246 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.51 
 
 
243 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
277 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  36.21 
 
 
246 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  36.21 
 
 
246 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 
292 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 
268 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  38.71 
 
 
254 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  37.89 
 
 
501 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
490 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 
266 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.69 
 
 
243 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  36.21 
 
 
246 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 
272 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  37.23 
 
 
278 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.51 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05529  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  34.69 
 
 
247 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001573  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.69 
 
 
247 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.74719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.47 
 
 
244 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 
299 aa  148  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  42.2 
 
 
269 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.47 
 
 
243 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.68 
 
 
265 aa  148  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.08 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.08 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.08 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  33.46 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.08 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.08 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
266 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.94 
 
 
243 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
255 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.1 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.74 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>