More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3469 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  97.01 
 
 		 268 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  85.6 
 
 		 254 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  79.47 
 
 		 263 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  85.83 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  77.19 
 
 		 262 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  77.19 
 
 		 262 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  76.43 
 
 		 262 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  63.89 
 
 		 263 aa  333  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  66.53 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  62.02 
 
 		 261 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  66.12 
 
 		 261 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  62.92 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  58.43 
 
 		 267 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.43 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  59.45 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  62.5 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  59 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  60.94 
 
 		 261 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  56.08 
 
 		 261 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  59.4 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  56.08 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  59.4 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  59.4 
 
 		 268 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  62.08 
 
 		 261 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  58.05 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  56.96 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  56.9 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  55.1 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  54.69 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  52.21 
 
 		 266 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.43 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  50.6 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  47.64 
 
 		 274 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  49.37 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  47.56 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.06 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  39.2 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  37.82 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  35.17 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  39.41 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.82 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.35 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.35 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  30.71 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  35.25 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  31.5 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  31.5 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  31.14 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  34.81 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  33.97 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 295 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 295 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  27.62 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.59 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.89 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  34.97 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.17 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  34.66 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.95 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  32.45 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>