More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1916 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1916  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  81.9 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  71.26 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 261 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  72.44 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  63.75 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  63.71 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  62.5 
 
 		 268 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  61.63 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  64.44 
 
 		 269 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  62.08 
 
 		 268 aa  308  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  58.24 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0932  extracellular solute-binding protein  62.92 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.214418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  58.24 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.17 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  57.79 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3329  extracellular solute-binding protein  57.98 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3190  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  57.98 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3449  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  57.2 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  55.04 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  59.41 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  59.41 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  58.58 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  60.34 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  55.77 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  58.97 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  58.97 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  56.72 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  56.36 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2432  glutamine ABC transporter extracellular solute-binding family 3 protein  52.94 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.0748361 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  52.71 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  53.78 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  52.76 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  52.02 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  49.01 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1686  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.38 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.373626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  51.21 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  48.97 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.1 
 
 		 274 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  52.53 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  45.96 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  37.07 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  36.97 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  38.03 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4667  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.71 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  31.6 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.74 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  32.45 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  33.88 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  31.68 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.89 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  28.3 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.8 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  33.06 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.95 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.47 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.05 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.05 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  30.32 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.54 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  31.28 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>