More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3481 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  42.97 
 
 
267 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 
281 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 
281 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  39.55 
 
 
284 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  40.56 
 
 
271 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
271 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 
270 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
276 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 
278 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
289 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  36.12 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9241  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  36.09 
 
 
272 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  38.34 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6372  extracellular solute-binding protein family 3  35.61 
 
 
280 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  38.33 
 
 
284 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 
278 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  38.33 
 
 
284 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  34.69 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 
284 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  34.29 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  35.27 
 
 
278 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 
279 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  33.46 
 
 
280 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2912  glutamine ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.93 
 
 
277 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.47 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.6 
 
 
272 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.55 
 
 
271 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.33 
 
 
272 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
271 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.96 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 
295 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 
295 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
292 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  33.07 
 
 
268 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.4 
 
 
268 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2595  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
272 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 
281 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30 
 
 
276 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 
286 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.63 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.42 
 
 
271 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.93 
 
 
324 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.69 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.26 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
290 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.35 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.35 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.35 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
295 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  34.09 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.73 
 
 
257 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.73 
 
 
257 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.87 
 
 
265 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
260 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
267 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
246 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.59 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.97 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.97 
 
 
266 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>