More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0553 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
276 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  98.91 
 
 
276 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  98.55 
 
 
276 aa  540  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  98.19 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  98.19 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  98.19 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  98.19 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  97.83 
 
 
276 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  96.74 
 
 
276 aa  534  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  97.83 
 
 
276 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  88.77 
 
 
275 aa  490  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  67.38 
 
 
286 aa  364  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  65.02 
 
 
281 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 
276 aa  255  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.81 
 
 
277 aa  250  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  46.1 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  47.25 
 
 
287 aa  230  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  42.22 
 
 
288 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  40.43 
 
 
319 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  43.75 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  46.58 
 
 
273 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  44.77 
 
 
271 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
270 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 
324 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  39.78 
 
 
278 aa  178  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.77 
 
 
324 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
332 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  36.8 
 
 
318 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  33.76 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 
326 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 
340 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  38.34 
 
 
295 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  36.94 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  38.21 
 
 
304 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  36.19 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  35.82 
 
 
296 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
341 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  38.82 
 
 
323 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  34.4 
 
 
294 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
290 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
305 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  36.26 
 
 
259 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  35.9 
 
 
259 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37.23 
 
 
315 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
292 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  35.9 
 
 
259 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  37.5 
 
 
264 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  34.21 
 
 
290 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  34.57 
 
 
271 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  36.05 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  39.39 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.28 
 
 
279 aa  146  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  37.39 
 
 
297 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.07 
 
 
271 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
276 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  36.36 
 
 
290 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  33.83 
 
 
275 aa  142  5e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  32.73 
 
 
278 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 
275 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  41.12 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
275 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
275 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
275 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 
295 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
267 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 
295 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
279 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
278 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  38.72 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 
246 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.32 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  39.81 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.77 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  34.89 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>