More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0201 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 324 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  89.84 
 
 		 332 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  79.26 
 
 		 331 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  79.26 
 
 		 331 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  80 
 
 		 331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  75.99 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  56 
 
 		 340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  49.4 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  48.11 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  47.74 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  41.91 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  38.83 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  38.98 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  38.03 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  37.12 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.71 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 275 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.71 
 
 		 276 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.29 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  35.86 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37.94 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 385 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.53 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  35.39 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  35.92 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  33.6 
 
 		 290 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.54 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  34.2 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.33 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.3 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  31.82 
 
 		 269 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.67 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.87 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 		 246 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  34.27 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  35.98 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  30.4 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  33 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.05 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.63 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  31.14 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.99 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.72 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.05 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  28.28 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  28.69 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 292 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>