More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  100 
 
 		 324 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  52.41 
 
 		 319 aa  288  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  47.74 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 340 aa  258  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  48.25 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  46.77 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  46.12 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  45 
 
 		 323 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.27 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.27 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.27 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.87 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.89 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.55 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  37.98 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  38.31 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  38 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  36.74 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  35.54 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  33.97 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  35.5 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.16 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.86 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.16 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  36.2 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  34.44 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  35.87 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.88 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  34.94 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  36.68 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.2 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  33.88 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  34.89 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  35.62 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  36.28 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.78 
 
 		 751 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 276 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  36.6 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.22 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  31.94 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  33.05 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  32.61 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.64 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  31.46 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.64 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  31.38 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  31.84 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  32.48 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  28.44 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>