More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0527 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  76.84 
 
 
277 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  58.24 
 
 
276 aa  318  7e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  53.02 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.65 
 
 
288 aa  260  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  47.25 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  46.15 
 
 
281 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  45.07 
 
 
286 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  46.1 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.47 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.47 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  45.79 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.1 
 
 
276 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  36.19 
 
 
273 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  36.52 
 
 
271 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
324 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
331 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
331 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
331 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  30.42 
 
 
319 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
271 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  28.81 
 
 
340 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
332 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.38 
 
 
279 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 
270 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  28.63 
 
 
328 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  35.41 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  33.33 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.86 
 
 
324 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
341 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.1 
 
 
284 aa  139  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 
305 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  31.42 
 
 
318 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  33.76 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  34.42 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 
278 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
246 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  32.93 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  36.79 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  40.58 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.42 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
271 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  34.42 
 
 
290 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
271 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
271 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  34.13 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.73 
 
 
259 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  34.13 
 
 
259 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.27 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.5 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  36.32 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  32.95 
 
 
275 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  28.95 
 
 
326 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  34.56 
 
 
290 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  33.04 
 
 
275 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
274 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 
281 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 
271 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.65 
 
 
254 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 
290 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  32.81 
 
 
279 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.17 
 
 
271 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  29.85 
 
 
289 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 
254 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
275 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  31.94 
 
 
323 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
282 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.57 
 
 
263 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  32.41 
 
 
279 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 
297 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 
264 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.27 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  32.41 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.25 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>