More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1164 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  60.77 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  61.15 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  60 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  47.55 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  48.88 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  41.85 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  41.35 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.67 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.93 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.86 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.5 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.11 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.45 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.42 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.26 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  34.26 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.68 
 
 		 271 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  32.45 
 
 		 279 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  32.68 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  32.06 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.48 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.84 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  31.15 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 341 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.69 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2098  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0603168  normal  0.126386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  33.19 
 
 		 324 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.36 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0338  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000810551  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.1 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  28.76 
 
 		 345 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  27.39 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  29.09 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.89 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  34.08 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 296 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  25.75 
 
 		 319 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.73 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  36.11 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  26.59 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1245  amino acid  36.36 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7860  extracellular solute-binding protein family 3  26.46 
 
 		 341 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  24.66 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003418  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.84 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.49248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02361  hypothetical protein  27.27 
 
 		 350 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0975  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.87 
 
 		 342 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0561977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.86 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  27.54 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>