More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1470 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  52.4 
 
 		 275 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  50.74 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  49.25 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  53.82 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  47.43 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  53.65 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  53.22 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  51.09 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  49.79 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  52.34 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  43.59 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  50.22 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  48.32 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  45.93 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  44.74 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  46.25 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  45.22 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  38.37 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  43.33 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  39.78 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  41.32 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  37.81 
 
 		 294 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  39.85 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  39.17 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  39.22 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  38.27 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  37.39 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.09 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  32.58 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.02 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.06 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.06 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  31.06 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.56 
 
 		 751 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.06 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.68 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  30.68 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.68 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.06 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  35.98 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.68 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  34.55 
 
 		 340 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  37.56 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.39 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  36.13 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.07 
 
 		 324 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  34.24 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.5 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  36.87 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.65 
 
 		 600 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.7 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  28.1 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 331 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.36 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  29.83 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.55 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.19 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  27.39 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.09 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  29.08 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  29.86 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.39 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.39 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>