More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1093 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
247 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  56.56 
 
 
247 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  59.47 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  55.47 
 
 
247 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  57.81 
 
 
248 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.09 
 
 
247 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.09 
 
 
247 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  59.38 
 
 
248 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  53.63 
 
 
248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.03 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  60 
 
 
249 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.84 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.44 
 
 
248 aa  270  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  54.92 
 
 
247 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  52.82 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  52.82 
 
 
248 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  55.8 
 
 
248 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  55.9 
 
 
248 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.58 
 
 
250 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.58 
 
 
250 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.16 
 
 
250 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.16 
 
 
250 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.16 
 
 
250 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.16 
 
 
250 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.16 
 
 
250 aa  254  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  51.35 
 
 
250 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  48.36 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  51.35 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  51.35 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  51.35 
 
 
250 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  50.67 
 
 
247 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  49.4 
 
 
252 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  52.32 
 
 
252 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  51.02 
 
 
254 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  45.49 
 
 
268 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  44.59 
 
 
284 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  42.17 
 
 
263 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  42.41 
 
 
264 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  42.57 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
513 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  42.73 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  39.11 
 
 
501 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  36.11 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  38.98 
 
 
272 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  37.44 
 
 
273 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.24 
 
 
254 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  33.92 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  33.47 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.65 
 
 
493 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  33.87 
 
 
244 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 
492 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  33.72 
 
 
251 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.24 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  33.94 
 
 
246 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.4 
 
 
265 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
260 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 
249 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.53 
 
 
266 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.53 
 
 
266 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.07 
 
 
272 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
247 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  32.67 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.08 
 
 
266 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.08 
 
 
266 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.08 
 
 
266 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.88 
 
 
269 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  30.12 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  30.12 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  33.04 
 
 
714 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  30.12 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.08 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.7 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.08 
 
 
285 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  34.14 
 
 
263 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.08 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.63 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.63 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.63 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>