More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3988 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 321 aa  631  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 275 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 275 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 275 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  53.9 
 
 		 282 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  61.37 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  60.52 
 
 		 279 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  51.89 
 
 		 274 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  46.76 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  56.49 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  58.08 
 
 		 297 aa  258  9e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  53.5 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  57.21 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  56.65 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  53.99 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  53.39 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  48.65 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  53.36 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  45.52 
 
 		 290 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  43.35 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  42.14 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  41.48 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  48.66 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  47.44 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  46.54 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  47.44 
 
 		 296 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  47.64 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  46.84 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  48.12 
 
 		 285 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  47.68 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  46.72 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  48.03 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  47.46 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  41.49 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.69 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.1 
 
 		 600 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  36.51 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  35.39 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.18 
 
 		 751 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  35.83 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.94 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.47 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.14 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.61 
 
 		 276 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  33.72 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  32.49 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.71 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  31.97 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.23 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  32.43 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  34.08 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  29.89 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.76 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 276 aa  113  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  29.92 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  32.37 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.22 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  30.7 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  31.11 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 267 aa  99.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 343 aa  99  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  28.04 
 
 		 284 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 265 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  29.07 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  30.23 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>