More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2813 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  53.6 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  44.53 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  42.01 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  45.04 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  40.15 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  39.27 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  39.51 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 		 286 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  38.32 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.74 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  36.13 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.74 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 275 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  36.33 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.74 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  34.75 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  31.29 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 305 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 296 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.05 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.1 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  33.98 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  32.5 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  33.72 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  31.64 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.41 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  30.88 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  29.53 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  30.07 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  32.55 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.95 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  32.64 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  30.39 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  31.71 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.4 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.73 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.57 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  32.77 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  30.89 
 
 		 289 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  32.35 
 
 		 274 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.31 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.32 
 
 		 284 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  28.05 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.32 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  35.52 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  30.4 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>