More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1118 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
277 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  64.96 
 
 
266 aa  318  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  45.45 
 
 
278 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  42.42 
 
 
274 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  37.93 
 
 
264 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  39.45 
 
 
259 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  39.45 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  39.06 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.52 
 
 
281 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.76 
 
 
286 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.51 
 
 
295 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.47 
 
 
273 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 
273 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.62 
 
 
276 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
276 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.99 
 
 
276 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  29.37 
 
 
319 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.99 
 
 
276 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
341 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
305 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.62 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5821  putative ABC transporter binding protein subunit  28.21 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.39 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
304 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
330 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  29.37 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.32 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
271 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67130  putative binding protein component of ABC transporter  28.21 
 
 
299 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  31.28 
 
 
304 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 
305 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  27.91 
 
 
271 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
302 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
334 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 
295 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
297 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  27.88 
 
 
291 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
294 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  28.25 
 
 
289 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.86 
 
 
297 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
270 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0658  putative glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein/periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.86 
 
 
460 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
294 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0659  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.86 
 
 
302 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
276 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0691  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  28.86 
 
 
302 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000300559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.49 
 
 
266 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.49 
 
 
285 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 
277 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.49 
 
 
266 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
298 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.49 
 
 
285 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  27.51 
 
 
298 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
315 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
294 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  24.63 
 
 
284 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.86 
 
 
359 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.86 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.86 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  26.86 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  26.86 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  26.86 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
323 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  26.86 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.73 
 
 
287 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4709  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866037  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  29.88 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
319 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
299 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
262 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
297 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
298 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
299 aa  99  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
330 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.9 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.22 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.22 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.22 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1364  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  27.67 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>