More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3458 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  83.51 
 
 		 298 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  76.21 
 
 		 298 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  71.24 
 
 		 297 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4073  extracellular solute-binding protein  72.28 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  68.67 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0828  extracellular solute-binding protein family 3  72.86 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0588  extracellular solute-binding protein family 3  67 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  66.67 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1219  extracellular solute-binding protein  68.14 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1364  extracellular solute-binding protein  66 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5026  extracellular solute-binding protein family 3  60.73 
 
 		 303 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0659  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.12 
 
 		 302 aa  334  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0691  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  56.12 
 
 		 302 aa  334  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000300559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0658  putative glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein/periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  57.25 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  54.13 
 
 		 299 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0311  extracellular solute-binding protein family 3  55.27 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  52.36 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  54.95 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  43.91 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  50.55 
 
 		 295 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  48.44 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  48.29 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  48.16 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  48.14 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.99 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  48.74 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  46.42 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  49.26 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  48.99 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  48.99 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  48.38 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  48.15 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.14 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  48.32 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  45.58 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  47.14 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.14 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  47.14 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  47.81 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  47.84 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  46.29 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  45.94 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  44.59 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  45.1 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  47.5 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 330 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  44.67 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.83 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0396  extracellular solute-binding protein  44.33 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0084  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.86 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.767728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  47.1 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0342  extracellular solute-binding protein  43.43 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.56 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  44.71 
 
 		 304 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5904  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2190  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0938958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2173  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3666  extracellular solute-binding protein family 3  43.39 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1071  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.43 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1100  extracellular solute-binding protein  46.79 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  44.78 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4738  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1112  extracellular solute-binding protein  46.07 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.455507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07320  amino acid ABC transporter, perplasmic binding protein  44.17 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4477  extracellular solute-binding protein family 3  41.84 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4341  extracellular solute-binding protein  46.07 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  43.43 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4438  extracellular solute-binding protein family 3  43.64 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.156595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  43.22 
 
 		 289 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4370  extracellular solute-binding protein  41.75 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3343  extracellular solute-binding protein family 3  42.52 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  47.04 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4612  extracellular solute-binding protein family 3  42.91 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  40.21 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46910  putative binding protein component of ABC transporter  45.3 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00378951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  43.77 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.02 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.02 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  45.02 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  45.02 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  45.02 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.02 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  45.02 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0701  extracellular solute-binding protein  46.13 
 
 		 302 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4043  putative ABC transporter binding protein subunit  44.95 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  45.23 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  44.26 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4740  extracellular solute-binding protein  39.67 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220117  normal  0.273761 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  44.32 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  44.78 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3961  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3908  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  45.56 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>