More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  67.76 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  57.2 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  47.04 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  45.78 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  49.22 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  45.99 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  48.25 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  47.88 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  47.88 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  47.88 
 
 		 275 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  45.95 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  47.21 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  46.75 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  47.32 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  47.23 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  47.21 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  46.29 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  41.77 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  38.62 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  42.73 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  42.8 
 
 		 275 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  40.48 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  44.86 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  40.91 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  38.7 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  38.4 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  38.98 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 		 275 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.43 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  39.92 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  39.02 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.18 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  35.84 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  39.18 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  35.98 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37.04 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  37.77 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  38.14 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  35.69 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  40.25 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  32.67 
 
 		 275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  36.48 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.97 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  35 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  37.69 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.33 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.62 
 
 		 751 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 		 513 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.19 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.28 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.6 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.79 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.26 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  32.74 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  28.87 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  31.97 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>