More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2222 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  67.03 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  53.33 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 275 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  47.43 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.6 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  47.15 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  49.36 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  50.44 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  48.75 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  47.11 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  47.75 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  39.71 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  41.61 
 
 		 323 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  44.71 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  39.53 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  46.19 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  46.61 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  44.77 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  44.63 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  37.83 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 323 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  44.18 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  41.37 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  41.86 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  40.98 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  42.21 
 
 		 281 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.77 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  38.3 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  40.91 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  36.12 
 
 		 355 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  39.06 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  34.76 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  35.87 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.35 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  34.06 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  32.42 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  33.18 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  33.75 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  35.35 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  30.17 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.25 
 
 		 600 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  37.36 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.18 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.29 
 
 		 751 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.92 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  33.5 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.17 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2306  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  35.42 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 324 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.42 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.42 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 343 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.96 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  27.38 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>