More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2201 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  79.86 
 
 		 279 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  86.08 
 
 		 279 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  61.86 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  48.07 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  48.88 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  47.67 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  53.36 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  50.57 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  56.79 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  53.2 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  48.85 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  51.69 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  49.15 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  46.64 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  55.66 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  55.22 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  56.4 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  48.22 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  44.22 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  47.14 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  52.08 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  46.24 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  52.05 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  48.43 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  48.95 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  47.88 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  44.2 
 
 		 282 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  48.93 
 
 		 290 aa  221  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  48.29 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  48.1 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  47.26 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  41.84 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  43.55 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  41.41 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34.33 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  34.6 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.23 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.23 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.87 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.87 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  31.87 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.87 
 
 		 276 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  34.47 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  34.3 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.14 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.14 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 331 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  33.05 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.77 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  32.88 
 
 		 340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  31.65 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.03 
 
 		 751 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 		 328 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.48 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.71 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 341 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  33.91 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  28.82 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  30.7 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  29.82 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  29.91 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.9 
 
 		 600 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.04 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.6 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.42 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.42 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.42 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.6 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.14 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  25.76 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  25.76 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>