More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1790 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
323 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  60.51 
 
 
355 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  50.61 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  50.61 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  50.61 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
279 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 
279 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  43.97 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  41.05 
 
 
289 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  48.64 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  42.86 
 
 
269 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 
277 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  45.53 
 
 
282 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  39.78 
 
 
274 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  46.25 
 
 
297 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  39.93 
 
 
275 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  44.4 
 
 
290 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  42.62 
 
 
294 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  39.53 
 
 
290 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  40.89 
 
 
296 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  43.41 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 
323 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  38.75 
 
 
282 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  41 
 
 
296 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 
283 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 
305 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 
285 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  38.46 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
294 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  39.6 
 
 
279 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
294 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  39.11 
 
 
295 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.95 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  34.59 
 
 
294 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  35.31 
 
 
281 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  37.8 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  35.43 
 
 
304 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  34.85 
 
 
286 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 
281 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.42 
 
 
323 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 
315 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.07 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.07 
 
 
276 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.07 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.74 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
276 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 
319 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.57 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.68 
 
 
600 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.11 
 
 
273 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.46 
 
 
324 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.43 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 
276 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
341 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  27.18 
 
 
278 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
302 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
318 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 
340 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.11 
 
 
751 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  26.77 
 
 
318 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
271 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  25.87 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  27.35 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  31.11 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  28.17 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  34.22 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.85 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  28.82 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
331 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
331 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.86 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
255 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  27.92 
 
 
274 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  25.17 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.39 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.34 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.07 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  28.03 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  25.71 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.8 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  24.15 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.35 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  25.62 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>