More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1512 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  58.24 
 
 
273 aa  318  7e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  59.13 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  53.85 
 
 
287 aa  287  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  48.53 
 
 
288 aa  263  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  49.82 
 
 
275 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  48.9 
 
 
276 aa  255  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  49.45 
 
 
276 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  49.45 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  49.09 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  49.09 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  49.09 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  49.09 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.91 
 
 
276 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  48.91 
 
 
276 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  49.09 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  47.25 
 
 
281 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  46.18 
 
 
286 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  36.5 
 
 
271 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
296 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  36.88 
 
 
273 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
270 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  35.22 
 
 
319 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
271 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  30.93 
 
 
328 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
324 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
331 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  36.45 
 
 
315 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.4 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 
341 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 
305 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  29.88 
 
 
326 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.08 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  30.63 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 
318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  37.4 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  33.69 
 
 
294 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  31.95 
 
 
289 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 
295 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
275 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  30.26 
 
 
284 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.07 
 
 
266 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
295 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  32.91 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 
319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
294 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  33.8 
 
 
290 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
294 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.37 
 
 
286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.4 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.8 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  31.66 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.73 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  32.17 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.01 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
290 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  30.45 
 
 
290 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 
276 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.62 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  34.23 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.11 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  33.94 
 
 
275 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.31 
 
 
268 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  30.18 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
292 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  30.39 
 
 
323 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
285 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 
295 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  31.95 
 
 
297 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4578  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
296 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575632 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  32.78 
 
 
295 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
279 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 
283 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.92 
 
 
251 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  34.51 
 
 
321 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
297 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>