More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4887 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
315 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  44.63 
 
 
323 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  41.7 
 
 
323 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  40.2 
 
 
294 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 
296 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  40 
 
 
290 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  39.6 
 
 
296 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  41.91 
 
 
305 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 
294 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  43.67 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 
294 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 
295 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  37.8 
 
 
275 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 
305 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  37.14 
 
 
319 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
275 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  38.33 
 
 
278 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  37.01 
 
 
328 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  36.76 
 
 
282 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
324 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.57 
 
 
281 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.94 
 
 
276 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
276 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  36.51 
 
 
304 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.94 
 
 
276 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  36.24 
 
 
289 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  34.35 
 
 
274 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.58 
 
 
276 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.58 
 
 
276 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  37.9 
 
 
278 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.58 
 
 
276 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
331 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.58 
 
 
276 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  38.63 
 
 
326 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.17 
 
 
277 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.04 
 
 
279 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 
281 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.21 
 
 
276 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 
286 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.21 
 
 
276 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.21 
 
 
276 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  34.76 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  35.54 
 
 
324 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  35.98 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
277 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 
340 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.33 
 
 
297 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  38.7 
 
 
279 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  36.82 
 
 
285 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  36.44 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
276 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 
321 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.82 
 
 
273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 
287 aa  135  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  32.82 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  35.4 
 
 
282 aa  132  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  34.38 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.09 
 
 
288 aa  129  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
341 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  34.08 
 
 
290 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 
355 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  32.51 
 
 
324 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
302 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
318 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29.1 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 
271 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
270 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
271 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.38 
 
 
264 aa  106  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
343 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.32 
 
 
259 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.32 
 
 
259 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
271 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
271 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  34.91 
 
 
328 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.03 
 
 
271 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
385 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
267 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.11 
 
 
277 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  25.94 
 
 
259 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
271 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
271 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>