More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2423 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 343 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  51.89 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  46.15 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  43.19 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  42.02 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  43.33 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  40.96 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  41.15 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  38.89 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 281 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.59 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.59 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.59 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 385 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  35.17 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  37.18 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.75 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.22 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.76 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.53 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  34.01 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.76 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 271 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 271 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.27 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.06 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.02 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  31.51 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.63 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 		 290 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  34.14 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  30.77 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  28.63 
 
 		 269 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.75 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.98 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  29.79 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3983  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3951  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.78 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5459  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  28.33 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.9 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  32.2 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.9 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 261 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.29 
 
 		 264 aa  99.4  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 		 278 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.51 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  33.02 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0306  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 261 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.06 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 266 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 305 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0907  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 254 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 283 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7667  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.56 
 
 		 279 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2073  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.19851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0877  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 269 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>