More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2159 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 355 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  37.59 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.11 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  33.72 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  34.78 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.91 
 
 		 328 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  31.16 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.03 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.03 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.03 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.03 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.76 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  31.76 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.48 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.05 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.83 
 
 		 276 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.58 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 		 281 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 305 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.59 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.05 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.05 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  27.99 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  27.38 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.41 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  28.33 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  28.03 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  28.92 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  29.11 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  25.57 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  28.84 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.11 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  31.39 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.98 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  28.99 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  26.69 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.31 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.58 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0627  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  24.16 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.04 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  25.21 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3652  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  27.08 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1420  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217844  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3462  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.8 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0438  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.503691 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  23.92 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2984  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3563  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1705  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.402619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4587  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.58 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>