More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3969 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  91.76 
 
 		 279 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  79.86 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  79.86 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  79.86 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  59.35 
 
 		 321 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  49.82 
 
 		 289 aa  265  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  49.09 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  45.61 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  52.49 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  49.43 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  55.19 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  51.88 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  56.61 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  47.74 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  50 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  51.05 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  56.11 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  44.29 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  49.26 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  54.35 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  51.32 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  52.14 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  51.94 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  48.52 
 
 		 294 aa  231  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  50.62 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  53.58 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  50 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  49.15 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  49.58 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  48.43 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  44.24 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  47.26 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  46.35 
 
 		 290 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  38.78 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  43.6 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  42.04 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  36.77 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  35.07 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  33.59 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  33.62 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  32.83 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  33.61 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  36.32 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.87 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  35.87 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.87 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.87 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.33 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.22 
 
 		 751 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 340 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  32.24 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.94 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  34.84 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.64 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  28.17 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.74 
 
 		 600 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.08 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  31.64 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2306  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  32.08 
 
 		 370 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.9 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.9 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  27.07 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 513 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.63 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.21 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>