More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2306 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2306  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  100 
 
 		 370 aa  754    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  48.81 
 
 		 328 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  32.86 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 279 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  35.42 
 
 		 269 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  35.29 
 
 		 290 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  36.65 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  32.07 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  31.92 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.37 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.17 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  32.56 
 
 		 275 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  35.96 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  33.52 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  28.25 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 296 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 282 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 285 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  31.91 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  29.83 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  28.8 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.36 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  33.88 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  32.05 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  33.51 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.13 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  27.56 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.87 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.2 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  29.77 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  31.52 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  28.16 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  33.52 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.61 
 
 		 751 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.72 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.64 
 
 		 600 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.35 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.53 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  32.85 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.68 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.44 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.05 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.59 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  30.04 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  27.83 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  27.83 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3397  hypothetical protein  30.04 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167886  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 		 3427 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  34.03 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  28.06 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4667  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2028  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.81 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  27.31 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.07 
 
 		 286 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.85 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.49 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.29 
 
 		 271 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  28.41 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>