More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1168 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
255 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
255 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  62.17 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  54.72 
 
 
271 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  54.7 
 
 
292 aa  256  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 
259 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  38.8 
 
 
260 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.5 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.5 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  34.89 
 
 
319 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.5 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
271 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.25 
 
 
276 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  26.25 
 
 
276 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.87 
 
 
276 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  25.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.47 
 
 
276 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.47 
 
 
276 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.87 
 
 
276 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 
273 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
276 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
275 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.91 
 
 
324 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 
290 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.19 
 
 
259 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  33.61 
 
 
259 aa  99  7e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  29.64 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.77 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  31.16 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
290 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
276 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 
326 aa  96.3  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
278 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.07 
 
 
273 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  31.47 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  30.04 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.37 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  27.96 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  27.96 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  31.63 
 
 
299 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  27.96 
 
 
279 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2874  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.23 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  31.63 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.34 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.33 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.09 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.22 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  28.49 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
276 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.36 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  26.64 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  28.87 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  24.7 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  29.83 
 
 
328 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  26.32 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.37 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.8 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.64 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
267 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.86 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2098  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0603168  normal  0.126386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0774  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220084  hitchhiker  0.00138708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  27.17 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>